在近视治疗的手术方式中，目前认为全飞秒激光手术是较安全的手术方式。因为通过飞秒激光治疗近视是在角膜基质层内磨制一个镜片，然后通过2mm的小切口将镜片取出，从而改变角膜的屈光状态，使患者的视力得到矫正。
因为不用制作角膜瓣，切口也较小，所以可以规避术后干眼或角膜瓣复位不良、角膜瓣下浑浊、角膜瓣感染等并发症。此外，因为全飞秒激光整个过程都由一种激光完成，而且飞秒激光的能量更强，所以它对角膜组织的损伤也较小。因此，全飞秒激光从手术损伤及术后发生并发症的可能性而言，都比一般的近视眼手术要低。
飞秒是一种激光技术，在临床上有时统称为飞秒激光，既包括全飞秒激光，也包括半飞秒激光，主要的区别如下：
1、全飞秒激光：实际上全程都使用飞秒激光，通过飞秒激光在角膜基质层内磨制镜片，通过2mm的小切口将镜片取出，从而改变角膜的屈光状态。全飞秒激光整体上全部使用飞秒激光，更为精确，通常手术的安全性比半飞秒激光好；
2、半飞秒激光：只是半程使用飞秒激光，通过飞秒激光制作角膜瓣，在瓣下实际上是用准分子激光进行切削、磨制镜片。角膜瓣复位以后，改变角膜的屈光状态，使患者视力得到提升。半飞秒激光结合准分子激光和飞秒激光两种激光技术，在治疗上实际上可以更精准，比以往的单纯的准分子激光技术而，有更好的手术效果。
全飞秒激光和半飞秒激光手术都属目前全飞秒激光仪器近视*高可以做到1000-1200度，散光*高可以做到500度，适不适合以及能不能做全飞秒手术，除了看近视和散光的度数以外，还需要结合参考很多其它的术前检查情况，比如角膜厚度够不够、角膜地形图情况、角膜形态是不是对称、有没有圆锥角膜倾向以及瞳孔大小，特别是晚上瞳孔的大小等。
手术有一套非常严格的术前检查和手术适应症，医生会根据术前检查的结果评估是不是适合做全飞秒手术。如果不适合，也可以有其它的手术方式矫正近视和散光。